Padronização de protocolo AFLP e sua capacidade informativa para análise da diversidade genética em Araucaria angustifolia

Abstract

Com o intuito de analisar a eficiência informativa de marcadores AFLP, investigouse a diversidade genética intrapopulacional de um remanescente de Floresta Ombrófila Mista do Estado de Santa Catarina. Foram selecionadas aleatoriamente sete combinações de iniciadores para reações AFLP, gerando 62 marcadores polimórficos, os quais foram utilizados para estudar uma população natural do Parque Ecológico Municipal de Lages, SC. Foi gerada uma matriz binária, a partir da qual foram determinados a diversidade genética pelo índice de Shannon (H= 0,54), o índice de similaridade de Jaccard entre indivíduos e construído o dendrograma correspondente. O número médio de bandas obtidas por iniciador foi de 89,3 e a porcentagem de bandas polimórficas foi de 9,8%. Estes índices de diversidade genética foram comparados àqueles obtidos a partir de marcadores isoenzimáticos (H=0,29; A=1,4; P=20%) e PCR-RFLP(H=0,0; A=1; P=0%). Realizando o agrupamento das plantas sem uma padronização de valor para a similaridade genética, sete grupos distintos foram obtidos, sendo que 46% das plantas formaram um único grupo com similaridade genética variando entre 45 e 75% e somente duas plantas apresentaram similaridade superior a 75%. Devido à ampla cobertura genômica proporcionada pela técnica AFLP, foi possível estimar a diversidade genética desta população, partindo-se do grau de similaridade genética entre os indivíduos e das bandas polimórficas. Apesar destas estimativas não serem equivalentes aos índices tradicionalmente utilizados (heterozigosidade e estatísticas F), a técnica AFLP pode ser considerada uma poderosa ferramenta para a análise da diversidade genética de populações naturais de araucária, possibilitando subsídios aos programas de melhoramento e conservação genética.

In order to analyze the informative efficiency of AFLP markers, the intrapopulational genetic variability in a remnant of the Rain Forest in the state of Santa Catarina was investigated. Seven primer combinations to AFLP reactions were tested, resulting in sixty two markers which were used in the study. A binary matrix was built, from which the genetic diversity was determined by using the Shannon's index (H= 0.54), the Jaccard's similarity index and the correspondent dendrogram. The mean number of marker bands per primer was 89.3 and 9.8% of the marker bands were polymorphyc. Those genetic diversity indexes were compared to indexes obtained by isozyme (H=0.29; A=1.4; P=20%) and PCR-RFLP (H=0.0; A=1; P=0%). Without using a standardized value for genetic similarity, seven distinct groups were obtained, while 46% of the plants formed a unique group with genetic similarity between 45 and 75%. Only just two plants showed similarity higher than 75%. Owing to the wide genomic coverage allowed by the AFLP 164 Diversidade genética em araucária technique, the genetic variability within population was estimated by the genetics similarity among plants and among polymorphic marker bands. Although these estimates are not equivalent to those traditionally used (heterozigosity and F-statistics), the AFLP technique can be considered a powerful tool for the analysis of genetic variability in Brazilian pine natural populations. This can become a valuable help to plant breeding and gene conservation.